2007年，成立保护区管理局。2012年1月，被国务院审定为新建国家级自然保护区。

保护区属野生动物类型自然保护区，主要保护对象为白头叶猴、黑叶猴等野生动物及其赖以生存的喀斯特石山森林生态系统。白头叶猴保护区拥有全球最多的野生白头叶猴种群数量，是我国具有国际意义的陆地生物多样性17个关键地区之一。其中，白头叶猴是我国特有珍贵濒危动物，具有较高价值，其研究价值并不亚于中国国宝—大熊猫，目前国外还没有白头叶猴活体和标本。

保护区建立30年以来，保护区管护成效显著，白头叶猴种群数量稳定增长，成为人与猴和谐相处的典范。2010年，保护区被中国野生动物保护协会确定为全国野生动物保护科普教育基地。2012年，保护区获广西野生动植物保护与自然保护区管理先进集体称号。

白头叶猴（Trachypithecus leucocephalus）俗称乌猿、白乌猿、白叶猴等，是我国广西特有的一种灵长类动物，是唯一一种由我国学者发现并命名的灵长类动物，也是广西野生动植物保护的旗舰物种。它是亚洲叶猴（leaf-eating monkey或langur）的一种，是以树叶为主要食物的植食性旧大陆猴类。在系统分类上，隶属灵长目（Primates）、猴科（Cercopithecidae）、疣猴亚科（Colobinae）。目前它仅分布于广西崇左市的江州区、扶绥县、龙州县和宁明县境内面积约200km2的喀斯特石山地区。白头叶猴已被列为国家一级保护野生动物和《濒危野生动植物种国际贸易公约》（CITES）附录Ⅱ物种。在2002年召开的第19届世界灵长类学大会上，白头叶猴被确定为全球25种最濒危和最需要保护的灵长类动物之一。2004年，白头叶猴又以其特有性、濒危性和高观赏价值，被一致推选为首届中国—东盟博览会吉祥物，享誉国内外。